FERRY, RAMDHANI (2016) CLUSTERING METAGENOM DENGAN METODE K-MEDOIDS PADA MODEL PEMROGRAMAN MAP-REDUCE. Other thesis, INSTITUT PERTANIAN BOGOR.
|
Text (CLUSTERING METAGENOM DENGAN METODE K-MEDOIDS PADA MODEL PEMROGRAMAN MAP-REDUCE)
21.pdf - Published Version Available under License Creative Commons Attribution Non-commercial Share Alike. Download (9MB) | Preview |
Abstract
Metagenom adalah ilmu yang mempelajari materi genetik yang diambil langsung dari lingkungan tanpa budidaya. Kendala yang terjadi pada analisis metagenom adalah bercampurnya fragmen DNA dan ukuran data yang sangat besar. Penelitian ini bertujuan untuk mengimplementasikan metode k-medoids menggunakan model pemograman map-reduce. Map-reduce adalah model pemrograman yang berguna untuk mengatasi data berukuran besar yang dapat diimplementasikan menggunakan Hadoop. Pada penelitian ini n-mers frequency digunakan untuk melakukan ekstraksi ciri dan Euclidean distance untuk mengukur jarak antar fragmen. Evaluasi clustering diukur menggunakan indeks Davies-Bouldin dan purity. Hasil implementasi map-reduce dievaluasi dengan speedup. Hasil evaluasi clustering menunjukan cluster dengan jumlah 3 memiliki nilai Indeks Davies-Bouldin terbaik dengan nilai 2.002. Nilai purity dari hasil clustering tersebut adalah 0.618 pada tingkat genus. Kata kunci: euclidean distance, k-medoids, map-reduce, n-mers frequency
| Item Type: | Thesis (Other) |
|---|---|
| Subjects: | A General Works > AS Academies and learned societies (General) |
| Divisions: | Fakultas Matematika dan Komputer > Prodi Teknik Informatika |
| Depositing User: | Rizki Handayani S.I.Pust |
| Date Deposited: | 29 Jul 2019 07:03 |
| Last Modified: | 29 Jul 2019 07:03 |
| URI: | http://repository.unugha.ac.id/id/eprint/623 |
Actions (login required)
 |
View Item |